François Lissarrague s'est formé en lettres classiques à la Sorbonne, il débute alors sa carrière en tant que professeur de lettres et enseigne en collège et lycée de 1972 à 1980. Après avoir rédigé sa thèse à l’École des Hautes Études en Sciences Sociales sous la direction de Pierre Vidal-Naquet, il entre comme chercheur au Centre national de la recherche scientifique de 1980 à 1995. Il sera par la suite directeur d’étude à l’École des Hautes Études en Sciences Sociales et nommé directeur émérite en 2016. Il est également chercheur au sein du laboratoire de recherches ANHIMA (Anthropologie et Histoire des Mondes Antiques).
Spécialiste de l’anthropologie et de l’image en Grèce ancienne il est l'auteur d’ouvrages et d’articles notables :
François Lissarrague, Claude Bérard, La Cité des Images, Nathan, Lausanne-Paris, 1984.
François Lissarrague, Un flot d’images : une esthétique du banquet grec, Adam Biro, Paris 1987.
François Lissarrague, L’Autre guerrier ; archers, peltastes, cavaliers dans l’imagerie attique, Paris-Rome, coll. Images à l’appui, La Découverte/EFR, Paris-Rome, 1990.
François Lissarrague, Irène Aghion, Claire Barbillon, Héros et dieux de l’antiquité. Guide iconographique, Flammarion, Paris, 1994.
François Lissarrague, « Epictetos egraphsen : the writing on the cup », in S. Goldhill, R. Osborne (éd.), Art and Text in ancient Greek culture, Cambridge 1994.
François Lissarrague, « Iconographie grecque : aspects anciens et récents de la recherche », in I. Colpo, I. Favaretto, F. Ghedini (dir.), Iconografia, 2001.
François Lissarrague, « Les vases ‘étrusques’ du comte de Caylus », in Aghion (dir.), Caylus, mécène du Roi, INHA, Paris, 2002.
François Lissarrague, « Intrusions au gynécée », dans P. Veyne, F. Lissarrague, F. Frontisi-Ducroux (éd.), Les mystères du gynécée, Paris, 1998.
François Lissarrague, La cité des satyres. Une anthropologie ludique (Athènes VIe-Ve siècle avant J.-C.), Editions de l'Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales, Paris, 2013.
François Lissarrague, « Fonctions de l’image en Grèce ancienne » in Encyclopaedia Universalis [en ligne].